Visi Balai Diklat Keagamaan Papua Kementerian Agama adalah Terwujudnya Sumber Daya Manusia (SDM) yang terampil bersaing profesional di Lingkungan Masyarakat
Misi Balai Diklat Keagamaan Papua Kementerian Agama adalah
1. Meningkatkan Kualitas SDM Melalui Pendidikan dan Pelatihan Tenaga Administrasi
2. Meningkatkan Kualitas SDM Melalui Pendidikan dan Pelatihan Tenaga Pendidikan dan Teknis Keagamaan
3. Meningkatkan Kualitas tata Kelola Diklat Keagamaan Papua